Результаты работы отделения биотехнологии ФГБУ «ВГНКИ» за август 2018 года

В августе текущего года сотрудники отделения биотехнологии Испытательного центра ФГБУ «ВГНКИ» прошли курсы повышения квалификации в Германии и в России, провели сотни исследований в рамках государственных и иных проектов и подготовили материалы научной публикации в части работы по изучению антибиотикорезистентности.

Отдел молекулярной биологии 

В период с 21 по 23 августа 2018 года ведущий научный сотрудник отдела молекулярной биологии Александра Богомазова приняла участие в курсе повышения квалификации «Анализ данных секвенирования нового поколения: введение в практику». Курс был организован компанией ecSeq Bioinformatics GmbH и прошел в городе Мюнхене (Германия). В ходе обучения получено представление о самых  современных инструментах анализа данных в области биоинформатики и наиболее часто используемых форматах файлов при статистическом анализе. Приобретенные знания будут применены для оценки качества чтения и анализа данных, получаемых после секвенирования на оборудовании Miseq в рамках прикладных научно-исследовательских работ.

В рамках работы для отдела «Клинико-диагностический центр» было проведено 80 молекулярно-генетических исследований для определения наследственных болезней, окрасов, групп крови и особенностей экстерьера животных. В рамках других проектов было произведено для подведомственных Россельхознадзору учреждений 245 наборов реагентов для выявления/идентификации ГМО методом мультиплексной полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени, из них 129 наборов для скрининговых исследований на наличие ГМО, 79 наборов для идентификации ГМ-линий сои, 25 наборов для выявления и идентификации растительной ДНК и 12 наборов для идентификации и количественного определения содержания ГМ-линий. Все произведенные в отделении наборы были использованы в ходе исследований в структурных подразделениях Россельхознадзора.

Отдел генодиагностики инфекционных болезней животных

В ходе выполнения государственной работы «Лабораторные исследования в рамках государственного эпизоотологического мониторинга» (в части идентификации рисков) сотрудники отдела генодиагностики инфекционных болезней животных исследовали 8 образцов мясных полуфабрикатов и колбасных изделий свиного происхождения на наличие ДНК вируса африканской чумы свиней и 24 образца биологического материала от крупного рогатого скота (КРС) на наличие ДНК возбудителя инфекционного ринотрахеита КРС. ДНК указанных возбудителей не обнаружена.

Было проведено 268 исследований биологического материала, поступившего от отдела «Клинико-диагностический центр» ФГБУ «ВГНКИ», для выявления возбудителей бактериальных, вирусных и грибковых инфекций животных и птиц методом ПЦР.

По результатам исследований штаммов, проводимых сотрудниками отдела в рамках работы по ведению и пополнению Всероссийской коллекции клеточных культур, штаммов вирусов, микробов и микропатогенов, подготовлены материалы статьи «Идентификация патотипов и генов антибиотикорезистентности музейных штаммов диареегенных Е. coli» (авторы Поболелова Ю. И., Яцентюк С. П.). Данные материалы будут представлены на Международной научно-практической конференции «Здоровье животных: современные научные подходы, направления, тенденции», которая состоится 22 ноября 2018 года в Москве. Конференция посвящена 120-летию ФГБНУ «Федеральный научный центр – Всероссийский научно-исследовательский институт экспериментальной ветеринарии имени К. И. Скрябина и Я. Р. Коваленко Российской академии наук».

Отдел по контролю ГМО

В период с 20 по 24 августа 2018 года сотрудники отдела Наталия Ярыгина, Марина Рыжова и заведующая отделением биотехнологии Мария Гергель прошли курс повышения квалификации «Тестирование кормов и пищевых продуктов на содержание ГМО с использованием ПЦР в режиме «реального времени»» на базе компании Eurofins GeneScan GmbH в городе Фрайбурге (Германия). Подробно о содержании курса сообщалось в отдельном релизе. 

В период с 1 по 28 августа 2018 года в отдел поступило 94 пробы для исследований в части контроля ГМО. Проведено более 350 исследований образцов кормов и кормовых добавок на наличие в них ГМО, идентификацию и определение количественного содержания ГМ-линий сои и кукурузы.

Отдел санитарной и клинической микробиологии

За период с 1 по 28 августа 2018 года в отделе были проведены исследования 27 образцов пищевой продукции (мясо, мясопродукты, молоко и молочная продукция) на 6 микробиологических показателей (Listeria monocytogenes, сальмонелла и другие), которые характеризуют безопасность пищевой продукции. Из 34 исследований нарушения микробиологической безопасности выявлены в 2 случаях в образцах молочной продукции.

В рамках других проектов были проведены исследования клинического материала: 1.  Микробиологический посев клинического материала с постановкой антибиотикочувствительности к выделенным культурам: исследовано 56 проб, из них 13 –  отрицательные. 2. Паразитологические исследования клинического материала: 21 проба, из них 5 – положительные.

Также с 9 по 10 августа 2018 года сотрудники отделения биотехнологии прошли курсы повышения квалификации «Охрана труда и промышленная безопасность в лабораториях. Правила хранения и учета прекурсоров в аналитических лабораториях».