Сотрудники ФГБУ «ВГНКИ» прошли курс повышения квалификации в области секвенирования нового поколения в Петергофе
В период с 23 по 28 сентября текущего года сотрудники ФГБУ «ВГНКИ» – младший научный сотрудник отдела молекулярной биологии Анастасия Сухоедова и научный сотрудник указанного отдела Бахтыгуль Ветошникова – прошли курс повышения квалификации в области секвенировния нового поколения (Next generation sequencing, NGS), проводившийся в городе Петергофе. Курс «Основы секвенирования нового поколения и интерпретации NGS-данных в клинической практике» был организован Санкт-Петербургским государственным университетом (СПбГУ) при поддержке компании «Альбиоген». По окончании курса сотрудники ФГБУ «ВГНКИ» получили сертификаты о его успешном завершении.
На лекциях курса освещались разные темы в области технологий NGS-секвенирования. Так, были рассмотрены следующие вопросы: «Экзомное секвенирование TruSeq Exome + IDT», «Клиническая интерпретация данных NGS. Разбор клинических случаев», «Основы NGS: приготовление библиотек. Анонс новинок портфолио», «Современная NGS-лаборатория», «Научные исследования на базе биобанка»; «Биоинформатические подходы анализа NGS-данных», «Основы NGS: технология SBS».
В ходе практических занятий сотрудники ФГБУ «ВГНКИ» научились готовить материалы (библиотеки) для последующего секвенирования NGS и получили навыки работы на секвенаторе нового поколения Illumina HiSeq2500. Организаторы курса провели для сотрудников ФГБУ «ВГНКИ» экскурсию по помещениям биобанка СПбГУ, где особое внимание сотрудников подведомственного Россельхознадзору учреждения привлекли криохранилища с автоматизированной системой управления, позволяющие хранить различный биоматериал при температуре –80 °С.
Благодаря состоявшемуся в ходе курса обучению специалисты ФГБУ «ВГНКИ» приобрели знания, необходимые для самого процесса секвенирования нового поколения (NGS) на системах высокопроизводительного секвенирования, а также для оценки качества чтения и анализа данных в рамках прикладных научно-исследовательских работ ФГБУ «ВГНКИ».
Для справки:
Секвенирование нового поколения – техника секвенирования (то есть определения нуклеотидной последовательности ДНК или РНК), которая дает возможность определить последовательность сразу нескольких участков генома, что значительно ускоряет процесс анализа. Техники секвенирования в последние годы стремительно совершенствуются и применяются во всех отраслях биотехнологий, в том числе в пищевой промышленности и в сельском хозяйстве.
